Yo utilizo GIMP, y supongo que sera el mismo proceso.
1* creas una capa en transparente o blanco (según gustos).
2** Abres el 1º frame, y el trans/blan lo colocas el final de las capas, para que actué de fondo y no moleste en la edicion (recuerda que si seleccionas una capa, al seleccionarla solo estarás editando esa img sin estorbar al resto :3 )
3* Para poder pegar el 2º frame. Están fácil como crear una una nueva capa: Editar -> Pegar como... -> Capa nueva y seleccionas el 2º frame.
Luego en el cuadro de capas, arrastras el 2º frame encima del 1º y entre capas vas jugando con la opacidad (transparencia) del siguiente frame para saber que vas a editar
Y así repetidas veces.
Aunque pensándolo bien. Si vas a editar un gif, seria que te bajases un programa viejo llamado
Jacs Animation Shop 3 y con la utilidad "
Papel de cebolla", para poder ver en el siguiente cuadro de frame que es lo que muestra el anterior
Saludos
PD: Si el fondo del frame de la img es color opaco (lease blanco, negro, verde, etc). Seria que dieses un color al alfa al ese color o bien utilizar la varita magica y deletear ese color

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PD2: Del ser distinto GIMP de fotochop, pido disculpas si no doy con lo acertado