Si estas usando la versión 1.5 de Akaio en adelante puedes usar cualquier archivo .sav, solo configuiralo en las opciones del Akaio desde el DS. Tambien puedes probar revisando que formato usa el Akaio que tienes, Acekard usa "juego.nds.sav" sin embargo sigue siendo un sav normal, así que bastaría con quitarle el "nds" a la extensión quedando "juego.sav"
Saludos...