Bueno, reviviste un tema con más de 20 días de inactividad, el punto es que las normas no son claras en este punto...por un lado tu duda va aqui y por otro está la inactividad del tema...en fin.
Tu duda...
El problema es el/los roms que intentas convertir. Debes asegurarte que son de Neo-Geo y de que corren en MAME, aún así puede que no funcione un rom en particular, debes intentar entonces con otro rom diferente. Hay que recordar que a pesar de ser un mismo rom, éste puede estar compuesto por diferentes archivos dentro del zip.
Por otro lado, hay roms o hack roms que requieren del rom original para que funcionen en MAME y de igual forma, para que sean convertidos a formato neo. Esto quiere decir que debes convertir ambas versiones del juego...un ejemplo:
Kof 96 USA = 12MB
Kof 96 Hack = 800KB
Si se trata de convertir solo el archivo del Hack obtendremos solo el archivo USA en formato neo, en cambio, si convertimos ambos obtenemos:
Kof 96 USA.neo = 26 MB
Kof 96 Hack.neo = 26 MB
Cabe señalar que los datos que use de ejemplo son eso...un ejemplo, no son reales pero así es como funciona...
Saludos...