bueno, si sabes un poco de ingles
puedes leer los tutos que trae mugen en la carpeta "docs"

alli te enteras que significan y como usarlos.
o postea aquí a ver si alguien sabe.
o busca tutos traducidos con google.

iron angelus explicaba esto en el tema de asistencia:

tilde (~) - to detect key releases
; egs. command = ~a ;release the a button
; command = ~D, F, a ;release down, press fwd, then a
; If you want to detect "charge moves", you can specify
; the time the key must be held down for (in game-ticks)
; egs. command = ~30a ;hold a for at least 30 ticks, then release
Es para saber con q boton/direccion comienza el comando

; dollar ($) - Direction-only: detect as 4-way
; egs. command = $D ;will detect if D, DB or DF is held
; command = $B ;will detect if B, DB or UB is held
Detecta las 4 direcciones, diferenciandolas de las intermedias DB, UB
Ejemplo
[Command]
name = "holdback";
command = /$B (si estas en UB, no va a funcionar)

..allí te vas haciendo una idea, no son signos sin sentido.
pero, tienes razon , no es comun.

..pd, yo tampoco los entiendo